Методиката за изработване на областна здравна карта бе оспорена пред Върховния административен съд от Националното 
сдружение на частните болници, Българската болнична асоциация, Сдружение на общинските болници в България, Федерация Български пациентски форум и ЦЗПЗ. По същество и методиката и областните комисии служат само за да придават по приемлив вид на разпределение на болници, лекари и легла, което отдавна е изчислено и направено.
Независимо от това, МЗ не е освободено от задължение да спазва правилата за приемане на нормативни административни актове, а в случая тези правила са нарушени изцяло.
Методиката ще послужи, като оправдание за закриване на болници, легла и лекарски практики. В резултат ще се ограничи предлагането на медицински услуги, последица от което е ограничаване на достъпа до медицинска помощ и райониране на болните.
Новата административната регулация ще изгони малкото останали инвеститори в здравеопазването.
Националната здравна карта бетонира статуквото и се явява непреодолимо препятствие пред развитието на Българското здравеопазване, защото забранява разкриването на нови лечебни заведения, разширяване на съществуващите и модернизацията им.
С внесената в съда жалба, се иска спиране на действието на методиката до окончателното произнасяне на съда.
